tisdag 30 april 2019

Angelägen forskning

En uppmärksam PHI,are har grävt fram en ny artikel där man använt sig av HoloMonitor.
Bloggen har helt missat den så tack Axel. I nästkommande nummer av husorganet Cytometry finns en artikel som handlar om användande av Machine Learning tillsammans med Digital Holografisk Mikroskopi. I detta fallet alltså PHI,s HoloMonitor.

Det är 6 forskare med amerikanska National Cancer Institute som backat dem finansiellt.
Visar på hur angelägen informationen de fått fram är.

Machine Learning with Optical Phase Signatures for Phenotypic Profiling of Cell Lines

Artikeln är låst som vanligt, men abstract och viss annan info går att få fram.

Abstract
Robust and reproducible profiling of cell lines is essential for phenotypic screening assays.
The goals of this study were to determine robust and reproducible optical phase signatures of cell lines for classification with machine learning and to correlate optical phase parameters to motile behavior. Digital holographic microscopy (DHM) reconstructed phase maps of cells from two pairs of cancer and non‐cancer cell lines. Seventeen image parameters were extracted from each cell's phase map, used for linear support vector machine learning, and correlated to scratch wound closure and Boyden chamber chemotaxis. The classification accuracy was between 90% and 100% for the six pairwise cell line comparisons. Several phase parameters correlated with wound closure rate and chemotaxis across the four cell lines. The level of cell confluence in culture affected phase parameters in all cell lines tested. Results indicate that optical phase features of cell lines are a robust set of quantitative data of potential utility for phenotypic screening and prediction of motile behavior. © 2019 International Society for Advancement of Cytometry

Nedan en screenshot som förtäljer vilken teknik och vilket instrument de använt sig av.

Bloggen tror att dessa forskares studier är en utveckling av de studier "vår" amerikanska forskare Robert Judson tidigare visat upp. Där han använde sig av HoloMonitor för att konstruera ett eget program baserad på Machine Learning. Här hittar man senaste jag skrev om det.

Big Surprise - Big Data - AI

Ska vi gissa att Robert väckt uppmärksamhet med sin forskning,såpass att en större amerikansk federal instution velat få fram mer information till gagn för cancerforskningen?
Skulle vara intressant att veta hur mycket de betalat forskarna för att snabba på studierna och få resultaten.
Nåväl, vi PHI,are lär snart få läsa mer om vad National Cancer Institute har för intresse i detta.

                                                                  Mvh the99

1 kommentar: