Söndagskrönika - Gemensam nämnare

Dagens ämne har även det ett tema.Vilket framgår i slutet. Här kommer 3 av de senaste forskningsrapporterna som publicerats. Jag inleder med en nyutgivning av en bok från Springer Nature som avhandlar metoder/protokoll för fenotypisk screening av celler.

Vad är då fenotypisk screening kanske ni undrar? Jo,det är en metod att undersöka hur celler påverkas vid yttre påverkan.Som i detta fall handlar om hur celler reagerar vid tillsättande av främmande substanser för att ta fram nya läkemedel. 5 amerikanska forskare har tagit fram protokoll för forskare världen över hur använda denna förhållandevis nya teknik. Standard har tidigare varit att screena (kontrollera) specifika molekyler/proteiner i cellen via tekniken Target based screening. Fördelen med denna teknik är att den centrerar på just specifika molekyler/proteiner vilket även är dess nackdel då den missar effekter utanför Target/målet för celler som fått smaka på nya substanser. Fenotypisk screening ger istället hela bilden kan man slarvigt säga då tillvägagångssättet följer den oinfärgade levande cellens utveckling över tid efter den fått smaka på ex ett nytt anticancerläkemedel.

Abstract

Digital holographic microscopy and other quantitative phase imaging methods provide accurate reconstructions of the microscale features of cells, related to cell shape, height, and index of refraction, useful for phenotypic profiling. The following section details a typical cell imaging experiment by digital holographic microscopy, image analysis, and machine learning steps directed toward phenotypic profiling of cells from one or more populations. The analysis results in single and multi-class classification and identification of typical and atypical cells.

Här ett kort utdrag ur den ickemöjligkopieringsbara texten: 

Min kommentar
Denna nya teknik vid läkemedelsframtagning har alltså nu ett protokoll att utgå ifrån vid användande av Digital Holografisk Mikroskopi (DHM) som ex HoloMonitor. Ett klart framsteg tolkar jag det som. 

PHI får ytterligare argument att använda i sin marknadsföring, om de är medvetna om detta protokoll vill säga.

---------------------------------------------------------------------

Nästa forskningsrapport daterad 4 Jan 2026 handlar om melanoma,hudcancer. Hur upptäcka den i tid för ökad chans till bot. Jag översätter utvalda delar ur studien betitlad:

Morphological and Optical Characterization of NRAS-Mutant Melanoma Cells and Primary Melanocytes via Quantitative Phase Imaging With Digital Holographic Microscopy

SAMMANFATTNING

Tidigt upptäckt av melanom, en mycket variabel och aggressiv form av hudcancer, är avgörande för att förbättra patientens resultat. Det är avgörande att skilja på maligna celler och normala melanocyter, och därför behövs märkningsfria avbildningsmetoder som kan göra detta. Med tanke på den genotoxiska effekten av UV-strålning är dessa mutationer många och påverkar många gener, inklusive NRAS; därför kan terapeutiska strategier riktas mot dessa återkommande mutationer. Den aggressiva naturen hos NRAS-mutant melanom bidrar till dålig patientprognos och understryker behovet av tidig diagnos. Denna studie använder kvantitativ fasavbildning (QPI) med digital holografisk mikroskopi (DHM) för att differentiera morfologin hos NRAS-mutanta SK-MEL-2-celler från melanocyter med hjälp av holografisk mikroskopi; dimensionsreduktionstekniker, inklusive huvudkomponentanalys (PCA), t-distribuerad stokastisk granninbäddning (t-SNE); och klustringstekniker, inklusive K-Means Elbow Plots och Hierarchical Clustering Dendrograms. Resultaten visade distinkta morfologier och geometrier mellan melanocyter och SK-MEL-2-celler, vilket indikerar att QPI med DHM kan fungera som ett etikettfritt verktyg för att identifiera optiska biomarkörer vid melanom.

Melanom är en dödlig hudcancer som kan vara svår att skilja från normala pigmentproducerande celler. Denna studie använder digital holografisk mikroskopi och avancerad dataanalys för att upptäcka specifika morfologiska och optiska skillnader mellan friska melanocyter och NRAS-mutanta melanomceller. Våra resultat visar att optiska egenskaper är bland de viktigaste egenskaperna som skiljer de två celltyperna åt. Dessa resultat belyser potentialen hos holografisk mikroskopi som ett märkningsfritt diagnostiskt verktyg och utgör en grund för att utveckla nya biomarkörer för att förbättra tidig upptäckt av NRAS-driven melanom.

Förekomsten av melanom, en allvarlig form av hudcancer som härstammar från pigmentproducerande melanocyter i epidermis, har stadigt ökat i USA, med mer än fördubblade frekvenser under de senaste tre decennierna. Trots att melanom endast utgör 4 % av hudcancerfallen står det för 75 % av hudcancerrelaterade dödsfall. Om melanom däremot upptäcks tidigt har det en överlevnadsgrad på ~94 %, vilket understryker nödvändigheten av tidig diagnos och behandling. /

Studien utgår från 2 hud-cellinjer där den ena är ofarlig (Melanocytes) medan den andra är dödlig (SK-MEL-2). Vikten av att snabbt kunna särskilja dessa är det forskarna trycker på. I studien har man använt HoloMonitor M4 för att identifiera den eländiga typen. Jag rekommenderar att man översätter hela studien till svenska och läser hur smart forskarna använder sig av HoloMonitor (17 hänvisningar). 
Här några av dessa: 

-Båda cellinjerna såddes och avbildades under 58 timmar med ett HoloMonitor M4 holografiskt bildmikroskop (Phase Holographic Imaging, Lund, Sverige). Alla inspelningar utfördes med ett HoloMonitor M4-system (Phase Holographic Imaging).

Vi placerade HoloMonitor M4-systemet i en standard CO2 inkubator (Thermo Fisher Scientific) under alla bildbehandlingar. Temperatur- och gasförhållanden hölls på 37°C och 5 % CO2 med hjälp av HoloMonitors inkubationskammare på scentopp (Phase Holographic Imaging), som ger en stabil miljö för långvarig live-cellinspelning. Alla bilder togs in och analyser utfördes med hjälp av HoloMonitor App Suite, version 4.0 (Phase Holographic Imaging).

Min kommentar
Denna studie från Michigan-Dearborn University kommer till slutsatsen : Dessa resultat belyser potentialen hos holografisk mikroskopi som ett märkningsfritt diagnostiskt verktyg och utgör en grund för att utveckla nya biomarkörer för att förbättra tidig upptäckt av NRAS-driven melanom./

När/om HoloMonitor får kliniskt godkännande är möjligheten mer än god att instrumentet används vid många av världens alla hudcancerkliniker-behandlare. Det i en ny dedikerad version förmodligen. MelaMonitor månne?

----------------------------------------------------------------------

Den sista forskningsrapporten väver samman bägge ovanstående. Fenotypisk screening vid melanoma.
Även här är det amerikanska forskare, ledda av HoloMonitor-fantasten R Torres,hudcancerforskaren av rang. 

A BRN2:MYC transcriptional axis regulates interconversion between therapy-resistant and tumorigenic phenotypes in melanoma

 23 Dec 2025

Sammanfattning

Metastatisk spridning och terapeutisk resistens är de främsta orsakerna till cancerdödlighet. För melanom bygger dessa processer på cellernas förmåga att växla mellan transkriptionella tillstånd. Även om det är lovande att rikta in sig farmakologiskt på transkriptionella tillstånd, är mekanismerna genom vilka melanomceller växlar mellan tillstånd – och hur dessa processer skiljer sig från melanocyter – fortfarande dåligt förstådda. Här isolerar vi distinkta melanomtillstånd med unika fenotyper: ett MYC-drivet tillstånd, nödvändigt för tumörinitiering men känsligt för BRAF-hämning, och ett dedifferentierat, invasivt BRN2-högstadium berikat i terapiresistenta celler men inte direkt tumörframkallande. Övergångar mellan fenotyper sker genom intermediära, mer differentierade tillstånd. Oväntat nog finns även BRN2-högstadiet i melanocyter, medan MYC-tillståndet är exklusivt för melanom. Melanomceller uppvisar också en ökad frekvens av övergångar mellan tillstånd. Dessa fynd visar att accelererad fenotypisk växling, snarare än enbart tillståndsdiversitet, är ett avgörande drag för melanomprogression.

Method details

Quantitative phase imaging to assess proliferation, motility, morphology and reporter fluorescence

100,000 cells were seeded per well of a standard tissue-culture treated 6-well polystyrene plate (Sarstedt 83.3920.005) for digital holographic cytometry (DHC) using the M4 Holomonitor (Phase Holographic Imaging, Sweden). Cells were monitored for 72 h. Morphology was analyzed using the HStudio Software and linear discriminant analysis.

Min kommentar
Nya insikter+ny teknik= nya lösningar på ett tidigare svårt problem. Ovanstående 3 studier visar nyckeln för att dyrka upp problematiken. Gemensamma nämnaren är HoloMonitor som ni säkert förstått efter läst igenom min text. Som del av ny teknik vid läkemedelsframtagning,som ett nytt diagnosinstrument vid klink för hudcancer,som instrumentet för pre-detektering av cancerceller i exemplet med melanoma. Någon smartare än jag kan säkert sy ihop alla 3 studierna till 1 gemensam lösning. Förhoppningsvis är PHI medvetna om den potential som öppnar sig och kan förvalta detta på bästa sätt. Mvh the99

PS. Slump att studierna med så tydliga beröringspunkter med varandra kom så tätt inpå varandra? 

23 Dec, 2 Jan och 4 Jan.

PPS. Söndagsinläggets innehåll är för bra för att hålla på infon till i morgon. Yours truly blev alldeles för excited efter ha pusslat samman dessa 3 studier idag så jag släpper infon i förväg. 😎