torsdag 25 mars 2021

Ett gemensamt forskningsprojekt

En förhandskopia av en kommande publicering beträffande en forskningsrapport om bröstcancer med dålig prognos för överlevnad finns nu tillgänglig på nätet.

Det är ett forskningsprojekt med 22 forskare från 8 olika universitet/institut i 4 länder inblandade vilket vibbar om komplexitet och svåra utmaningar i att hitta lösning på problematiken med en idag svårbotad bröstcancer.

Bland forskarnas universitetshemvister finner vi idel kända HoloMonitorkunder. 
Från England hittas Imperial College London.
Från Australien hittas 3 universitet.Nämligen Monash University,QIMR Berghofer Medical Research Institute och University of Queensland.Sistnämnda universitet som 2018 levererade en studie med den tillhörande braskande kommentaren “We believe we’ve found the Holy Grail”.
 
Kan man kalla det ett HoloMonitorgemensamt forskningsprojekt då? Klart man inte kan,men intressant ändå att forskarna har instrumentet som den gemensamma nämnaren.
 
Studien är knepig att kopiera då den enbart är en förhandskopia med jobbiga radbrytningar och annat jox som gör den omöjlig att få in här på bloggen.Det är förvisso ett arbetsmaterial så det färdiga resultatet lär se helt annorlunda ut. Men det jag kan få in ser ni nedanför.

Posted March 23, 2021 

Abstract
Background: The nucleocytoplasmic shuttling of ERK5 has gained recent attention as a regulator of its diverse roles in cancer progression but the exact mechanisms for this shuttling are still under investigation.
Methods: Using in vitro, in vivo and in silico studies, we investigated the roles of shorter ERK5 isoforms in regulating the nucleocytoplasmic shuttling of active phosphorylated-ERK5 (pERK5). Retrospective cohorts of primary and metastatic breast cancer cases were used to evaluate the association of the subcellular localization of pERK5 with clinicopathological features.
Results: Extranuclear localization of pERK5 was observed during cell migration in vitro and at the invasive fronts of metastatic tumors in vivo.
The nuclear and extranuclear cell fractions contained different isoforms of pERK5, which are encoded by splice variants expressed in breast and other cancers in the TCGA data.
One isoform, isoform-3, lacks the C-terminal transcriptional domain and the nuclear localization signal.
The co-expression of isoform-3 and full-length ERK5 associated with high epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and poor patient survival.
Experimentally, expressing isoform-3 with full-length ERK5 in breast cancer cells increased cell migration, drove EMT and led to tamoxifen resistance.
In breast cancer patient samples, pERK5 showed variable subcellular localizations where its extranuclear localization associated with aggressive clinicopathological features, metastasis, and poor survival.

Conclusion: Our studies support a model of ERK5 nucleocytoplasmic shuttling driven by splice variants in an interplay between mesenchymal and epithelial states during metastasis.
Using ERK5 as a biomarker and a therapeutic target should account for its splicing and context-dependent biological functions. 

Methods

Cell migration and motility assays
Real  time  cell  motility  assays  were  carried  out  using  the  HoloMonitor® M4  system  (PHI,  Lund  Sweden) as per manufacturer instructions; 25-28 cells were tracked over 48 hours.
Real time migration   assays   were   performed   using   the   xCELLigence   system   (CIM-Plate®;   ACEA   Biosciences  Inc.,  San  Diego,  CA,  USA).  To  promote  cell  migration,  20%  serum  and  100 nM  estradiol (E2) were used as a chemoattractant in the base of the CIM-Plates.


(D) 

Real time cell motility assays using the HoloMonitor® M4 system
Cell motility of 25-28 cells was tracked (left); inner and outer circles mark 50 and 100 μm distance, respectively. Comparison of cell motility over time (right) of the four MCF7 cell lines showed that only isoform-3 expressing cells had a significant increase (P<0.001, end-point comparison, one-way ANOVA). Cell migration assays, Transwell using CIM-plates, also showed increased cell migration of MCF7 cells expressing isoform-3 (Figure S3F).

Min kommentar
Återigen en forskningsrapport där man hittar instrumenten HoloMonitor och xCELLigence system tillsammans. Hmmm....
Bägge instrumenten kompletterar varandra bra vilket VD Egelberg redan i en kommentar 2018 nämner i samband med att Agilent köpte upp ACEA Biosciences som ägare till xCELLigence.En affär på 2,2 miljarder Skr.
" VD Peter Egelberg :
- Likt IncuCyte, förvärvat av Sartorius för drygt ett år sedan, kan xCelligence från ACEA enbart mäta en cellpopulation in sin helhet. HoloMonitor tar cellanalys till nästa nivå genom att göra det möjligt att utan infärgning eller genmanipulation även mäta individuella cellers beteende i en population av levande celler. 
HoloMonitor kompletterar därför både xCelligence och IncuCyte. Att kunna mäta enskilda celler är viktigt för bl.a. cancerforskare eftersom forskningen idag vet att enbart ett fåtal tumörceller har förmågan att sprida cancern. Cancer karakteriseras av två saker: tillväxt och spridning. HoloMonitor gör det möjligt att samtidigt och utan infärgning mäta båda egenskaperna på cellnivå. "

Jag skulle inte bli sådär värst förvånad om vi kommer få se HoloMonitor + xCELLigence i ett affärs"bröllop" i en framtid.Bjässen Agilent Technologies med ett börsvärde runt 400 Miljarder Skr har säkert koll på forskarnas förtjusning i att använda bägge instrumenten simultant i sina studier.
En kul detalj i sammanhanget är att Agilent 2008 köpte upp Varians division Scientific Instruments.
Varian som sen renodlade sin verksamhet och blev en konkurrent till svenska Elekta på marknaden för cancerbehandling.Elekta som snart kommer förvärva strålpositioneringsföretaget C-rad.
Varian är för övrigt under uppköp av den större bjässen tyska Siemens.
En konsolidering av marknaden som gör att jag tror Elekta ganska så snart vill införliva C-rad i sin verksamhet.

 
                                         Mvh the99

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar